Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01735 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01735 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01735 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01735 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01735 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01735 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01735 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms