Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01672 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01672 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01672 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01672 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01672 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01672 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01672 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01672 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01672 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01672 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01672 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01672 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01672 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01672 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01672 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01672 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01672 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01672 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01672 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01672 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01672 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01672 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01672 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01672 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01672 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms