Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01665 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01665 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01665 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01665 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01665 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01665 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01665 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01665 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01665 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01665 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01665 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01665 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01665 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01665 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01665 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01665 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01665 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01665 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01665 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01665 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01665 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01665 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01665 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01665 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01665 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01665 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01665 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01665 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01665 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01665 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01665 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01665 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01665 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01665 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01665 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01665 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01665 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01665 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01665 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01665 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01665 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01665 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01665 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01665 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01665 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01665 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01665 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01665 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms