Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01656 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01656 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01656 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01656 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms