Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01654 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01654 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01654 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01654 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01654 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01654 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01654 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01654 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01654 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01654 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01654 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01654 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01654 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01654 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01654 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01654 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01654 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01654 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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