Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Casp8O89110 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms