Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MscO88940 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MscO88940 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MscO88940 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MscO88940 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MscO88940 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MscO88940 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MscO88940 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MscO88940 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MscO88940 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MscO88940 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MscO88940 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MscO88940 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MscO88940 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MscO88940 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MscO88940 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MscO88940 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MscO88940 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MscO88940 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MscO88940 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms