Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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