Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BlmO88700 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BlmO88700 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BlmO88700 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BlmO88700 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BlmO88700 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BlmO88700 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BlmO88700 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BlmO88700 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BlmO88700 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BlmO88700 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BlmO88700 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BlmO88700 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BlmO88700 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BlmO88700 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BlmO88700 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BlmO88700 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BlmO88700 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BlmO88700 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BlmO88700 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BlmO88700 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BlmO88700 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BlmO88700 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BlmO88700 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BlmO88700 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BlmO88700 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BlmO88700 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BlmO88700 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BlmO88700 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BlmO88700 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BlmO88700 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BlmO88700 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BlmO88700 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BlmO88700 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BlmO88700 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BlmO88700 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BlmO88700 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BlmO88700 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BlmO88700 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BlmO88700 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BlmO88700 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms