Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng2O88602 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cacng2O88602 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng2O88602 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng2O88602 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng2O88602 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng2O88602 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng2O88602 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng2O88602 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng2O88602 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng2O88602 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng2O88602 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng2O88602 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng2O88602 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng2O88602 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng2O88602 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng2O88602 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cacng2O88602 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng2O88602 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng2O88602 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng2O88602 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng2O88602 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng2O88602 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng2O88602 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng2O88602 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng2O88602 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms