Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dll3O88516 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms