Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkcO88445 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms