Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms