Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a1O88207 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col5a1O88207 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col5a1O88207 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col5a1O88207 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col5a1O88207 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col5a1O88207 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col5a1O88207 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col5a1O88207 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col5a1O88207 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col5a1O88207 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col5a1O88207 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms