Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vamp4O70480 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms