Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SfnO70456 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SfnO70456 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SfnO70456 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SfnO70456 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SfnO70456 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SfnO70456 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SfnO70456 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SfnO70456 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SfnO70456 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SfnO70456 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SfnO70456 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SfnO70456 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SfnO70456 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SfnO70456 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SfnO70456 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SfnO70456 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SfnO70456 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SfnO70456 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SfnO70456 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SfnO70456 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SfnO70456 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms