Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx2O70340 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx2O70340 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx2O70340 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx2O70340 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx2O70340 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx2O70340 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx2O70340 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx2O70340 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx2O70340 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx2O70340 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx2O70340 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms