Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lnx1O70263 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lnx1O70263 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms