Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms