Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cbx4O55187 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms