Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms