Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap2O55126 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms