Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrxO55103 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrxO55103 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrxO55103 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrxO55103 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrxO55103 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrxO55103 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PrxO55103 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrxO55103 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrxO55103 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrxO55103 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrxO55103 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PrxO55103 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PrxO55103 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PrxO55103 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrxO55103 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrxO55103 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrxO55103 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PrxO55103 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrxO55103 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrxO55103 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrxO55103 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrxO55103 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrxO55103 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrxO55103 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrxO55103 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrxO55103 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrxO55103 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrxO55103 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrxO55103 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrxO55103 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrxO55103 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrxO55103 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrxO55103 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrxO55103 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrxO55103 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrxO55103 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PrxO55103 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PrxO55103 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrxO55103 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrxO55103 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrxO55103 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrxO55103 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrxO55103 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrxO55103 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrxO55103 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrxO55103 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrxO55103 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrxO55103 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrxO55103 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrxO55103 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrxO55103 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrxO55103 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms