Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlkO54988 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlkO54988 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlkO54988 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlkO54988 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlkO54988 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlkO54988 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlkO54988 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlkO54988 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlkO54988 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlkO54988 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlkO54988 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlkO54988 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlkO54988 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlkO54988 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlkO54988 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SlkO54988 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SlkO54988 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SlkO54988 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SlkO54988 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlkO54988 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SlkO54988 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SlkO54988 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SlkO54988 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SlkO54988 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SlkO54988 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SlkO54988 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SlkO54988 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms