Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NlkO54949 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NlkO54949 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NlkO54949 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NlkO54949 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NlkO54949 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NlkO54949 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NlkO54949 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NlkO54949 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NlkO54949 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NlkO54949 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NlkO54949 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NlkO54949 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NlkO54949 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NlkO54949 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NlkO54949 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NlkO54949 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NlkO54949 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NlkO54949 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NlkO54949 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NlkO54949 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NlkO54949 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NlkO54949 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NlkO54949 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NlkO54949 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms