Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EdaO54693 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EdaO54693 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EdaO54693 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms