Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm44O35857 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms