Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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