Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch2O35516 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Notch2O35516 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms