Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edil3O35474 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Edil3O35474 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edil3O35474 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Edil3O35474 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edil3O35474 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Edil3O35474 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms