Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms