Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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