Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms