Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd2O35392 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd2O35392 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms