Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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