Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Dgcr6O35347 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Dgcr6O35347 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Dgcr6O35347 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms