Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms