Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Nedd9O35177 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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Nedd9O35177 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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