Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms