Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gfra3O35118 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gfra3O35118 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gfra3O35118 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gfra3O35118 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gfra3O35118 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra3O35118 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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