Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scarb2O35114 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scarb2O35114 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scarb2O35114 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scarb2O35114 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scarb2O35114 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scarb2O35114 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scarb2O35114 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scarb2O35114 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scarb2O35114 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scarb2O35114 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scarb2O35114 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Scarb2O35114 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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