Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3cO35066 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms