Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap23O09044 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snap23O09044 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Snap23O09044 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snap23O09044 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap23O09044 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap23O09044 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Snap23O09044 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap23O09044 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap23O09044 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snap23O09044 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap23O09044 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snap23O09044 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap23O09044 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap23O09044 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap23O09044 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap23O09044 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap23O09044 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap23O09044 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap23O09044 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap23O09044 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap23O09044 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap23O09044 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap23O09044 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Snap23O09044 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Snap23O09044 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Snap23O09044 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap23O09044 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap23O09044 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap23O09044 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snap23O09044 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snap23O09044 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snap23O09044 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snap23O09044 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Snap23O09044 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snap23O09044 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snap23O09044 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snap23O09044 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snap23O09044 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snap23O09044 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snap23O09044 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Snap23O09044 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snap23O09044 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms