Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Degs1O09005 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Degs1O09005 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Degs1O09005 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Degs1O09005 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Degs1O09005 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Degs1O09005 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Degs1O09005 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Degs1O09005 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Degs1O09005 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Degs1O09005 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Degs1O09005 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Degs1O09005 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Degs1O09005 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Degs1O09005 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Degs1O09005 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Degs1O09005 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms