Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EllO08856 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EllO08856 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EllO08856 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EllO08856 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EllO08856 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EllO08856 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EllO08856 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EllO08856 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EllO08856 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EllO08856 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EllO08856 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EllO08856 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EllO08856 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EllO08856 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EllO08856 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EllO08856 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EllO08856 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EllO08856 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EllO08856 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EllO08856 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EllO08856 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EllO08856 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EllO08856 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EllO08856 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EllO08856 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EllO08856 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EllO08856 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EllO08856 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms