Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms