Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn5O08688 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn5O08688 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn5O08688 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn5O08688 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn5O08688 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn5O08688 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms