Protein–RNA interactions for Protein: O08644

Ephb6, Ephrin type-B receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb6O08644 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb6O08644 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb6O08644 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb6O08644 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms