Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CltaO08585 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CltaO08585 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CltaO08585 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltaO08585 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltaO08585 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltaO08585 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltaO08585 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CltaO08585 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltaO08585 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CltaO08585 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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