Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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